Bozulmuş bağırsak florasını tekrar dengeye getirmek için bağırsak temizliği gerekli olabilir. Bu genellikle bağırsakların temizlenmesi, çevrenin iyileştirilmesi ve bitki örtüsünün yeniden inşasından oluşur. Alışılagelmiş lavmandan farklı olarak kolon hidroterapisinde su ve çözünmüş bağırsak içeriği bir hortum aracılığıyla tekrar boşaltılır. Bu, işlemin tamamen kokusuz ve temiz olduğu anlamına gelir. Toplamda kolon temizliği yaklaşık bir saat sürer. Çoğu hasta tedaviyi keyifli buluyor. Birçok kişi kolon hidroterapisinden hemen sonra kendini enerjik ve tazelenmiş hisseder.

Bu çalışmalar tek başına tedavi veya terapi amaçlı değildir. Kişilerin sağlık sorunları yoksa koruyucu etkiler gösterebilir, sağlık sorunları varsa da iyileşme süreçlerinde destekleyici olabilir. Çünkü bedenlerimiz herşeyin kaydını tutar ve herkeste bir şekilde blokajlar oluşturur. Bu blokajlar serbest kaldıkça, kişinin bedensel ve duygusal sağlık durumlarında olumlu değişim ve dönüşümler gözlemlenebilir.